Deklarasi penerapan sistem penjaminan mutu Universitas Muhammadiyah Magelang dilaksanakan sabtu 29 Desember 2009 oleh Rektor Universitas Muhammadiyah Magelang Prof. Dr. H. Ahmadi. Dalam acara tersebut secara simbolis diserahkan perangkat mutu dari Wakil Rektor I Ir. Eko Muh Widodo, M.T kepada Rektor. Untuk selanjutnya perangkat mutu tersebut akan didistribusikan ke setiap unit untuk diimplementasikan. Direncanakan bulan Maret 2010 akan diadakan Audit Mutu Internal pertama dengan fokus ketersediaan perangkat mutu dan pelaksanaanya.
