Program kerja Badan Penjaminan Mutu Universitas Muhammadiyah Magelang dalam rangka untuk menjamin mutu di tingkat Biro, Unit, UPT, Badan dan Lembaga di Universitas Muhammadiyah Magelang perlu adanya Audit Mutu Non Akademik Internal (AMNAI) dengan tujuan untuk meningkat kualitas penjaminan mutu dengan standar BAN-PT.